Gphys インストール

本ページでは, 一般ユーザで Gphys のインストールを行う方法を解説しています. 簡単にインストールするには, 電脳 ruby プロジェクト ページのインストールガイドから各 OS についてパッケージ化されていますので, そちらをご利用下さい.

（過去の C 版 DCL を用いた同様のインストール方法は こちら）

導入環境

ここでは, 一般ユーザ権限しかないマシン上で gphys をインストールする.

  • 作業ディレクトリ: /home/hoge/work
  • インストールディレクトリ: /home/hoge/usr/local

関連ツールのインストール

Gphys のインストールは rubygem を用いて行うが, ruby がインストールされていない環境を想定して, 関連ツールをソースからビルド・インストールを行う.

  • 関連ツール一覧 (＊は既にシステムにインストールされているものを利用するならスキップ可能)
    • NetCDF-4 (zlib, szip, hdf5) ＊
    • ruby ＊
    • rubygem ＊
    • dcl
    • fftw3 (オプション) ＊

  1. 環境変数の設定

    $ export CC=gcc
$ export FC=gfortran
$ export F77=gfortran

  2. NetCDF のインストール

    # zlib のインストール
$ cd ~/work
$ wget https://zlib.net/zlib-1.2.8.tar.gz  # リンクのバージョンは最新を利用
$ tar zxvf zlib-1.2.8.tar.gz
$ cd zlib-1.2.8
$ ./configure --prefix=/home/hoge/usr/local
$ make
$ make install

# szip のインストール
$ cd ~/work
$ wget https://support.hdfgroup.org/ftp/lib-external/szip/previous/2.1/src/szip-2.1.tar.gz  # リンクのバージョンは最新を利用
$ tar zxvf szip-2.1.tar.gz
$ cd szip-2.1
$ ./configure --prefix=/home/hoge/usr/local
$ make
$ make install

# hdf5 のインストール
$ cd ~/work
$ wget https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.8/hdf5-1.8.16/src/hdf5-1.8.16.tar.gz  # リンクのバージョンは最新を利用
$ tar zxvf hdf5-1.8.16.tar.gz
$ cd hdf5-1.8.16
$ ./configure --prefix=/home/hoge/usr/local --with-szlib=/home/hoge/usr/local --with-zlib=/home/hoge/usr/local --enable-fortran2003 --enable-cxx --enable-static-exec -enable-production --enable-hl --enable-fortran
$ make
$ make install

# netcdf のインストール
$ cd ~/work
$ wget ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4.1.3.tar.gz  # リンクのバージョンは最新を利用
$ tar zxvf netcdf-4.1.3.tar.gz
$ cd netcdf-4.1.3
$ export CPPFLAGS="-L/home/hoge/usr/local/loca/lib -I/home/hoge/usr/local/loca/include"
$ export LDFLAGS="-L/home/hoge/usr/local/lib -I/home/hoge/usr/local/include"
$ export LIBS="-lsz"
$ ./configure --prefix=/home/hoge/usr/local --with-hdf5=/home/hoge/usr/local --with-zlib=/home/hoge/usr/local --with-szlib=/home/hoge/usr/local --enable-netcdf-4 --enable-shared --enable-dap --enable-fortran --enable-cxx
$ make
$ make install

  3. ruby のインストール

    $ cd ~/work
$ wget https://cache.ruby-lang.org/pub/ruby/2.0/ruby-2.0.0-p648.tar.gz
$ tar zxvf ruby-2.0.0-p648.tar.gz
$ cd ruby-2.0.0-p648/
$ ./configure --prefix=/home/hoge/usr/local
$ make
$ make install

  4. dcl のインストール

    $ cd ~/work
$ wget https://www.gfd-dennou.org/library/dcl/dcl-7.4.9.tar.gz  # dcl-7.4 から C 版 dcl は不要
$ tar zxvf dcl-7.4.9.tar.gz
$ cd dcl-7.4.9/
$ ./configure --prefix=/home/hoge/usr/local --enable-shared  # gtk3 がインストールされていなければ, --with-gtk2 も必要
$ make
$ make install

  5. fftw3 のインストール (オプション)

    $ cd ~/work
$ wget http://www.fftw.org/fftw-3.3.10.tar.gz  # リンクのバージョンは最新を利用
$ tar zxvf fftw-3.3.10.tar.gz
$ cd fftw-3.3.10/
$ ./configure --prefix=/home/hoge/usr/local --enable-shared
$ make
$ make install

  6. 環境変数にインストールしたライブラリのパスを通す

    $ vim ~/.bashrc

export PATH=$PATH:/home/hoge/usr/local/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/hoge/usr/local/lib

$ source ~/.bashrc

  7. rubygem のインストール

    $ cd ~/work
$ wget https://github.com/rubygems/rubygems/archive/refs/tags/v2.0.14.zip  # リンクのバージョンは ruby の対応バージョン
$ unzip v2.0.14.zip
$ cd rubygems-2.0.14/
$ ruby setup.rb

gphys のインストール (gem による)

  • gem 環境の設定

    $ vim ~/.gemrc

    内容

    gem: "--user-install"

  • 各パッケージインストール

    $ gem install narray  # narray
$ gem install narray_miss  # narray_miss
$ gem install ruby-netcdf -- --build-flags --with-netcdf-lib=/home/hoge/usr/local/lib --with-netcdf-include=/home/hoge/usr/local/include  # ruby-netcdf
$ gem install ruby-dcl -- --build-flags --with-narray-include=/home/hoge/.gem/ruby/2.0.0/gems/narray-0.6.1.2   # ruby-dcl
$ gem install ruby-fftw3 -- --build-flags --with-fftw3-include=/home/hoge/usr/local/include --with-fftw3-lib=/home/hoge/usr/local/lib   # ruby-fftw3
$ gem install gphys -- --build-flags --with-netcdf-dir=/home/hoge/usr/local --with-narray-include=/home/hoge/.gem/ruby/2.0.0/gems/narray-0.6.1.2   # gphys

  • gphys 環境変数設定

    $ vim ~/.bashrc

    内容

    export PATH=$PATH:/home/hoge/.gem/ruby/2.0.0/bin

    変更内容の反映

    $ source ~/.bashrc

gpview 実行テスト

以下のコマンドを実行し, 空のウィンドウが表示されれば正常にインストールされている:

$ gpview

Gphys の使い方

詳しくは冒頭のチュートリアル等参照. ここでは, 正常にインストールできているかを確認するために, 以下のようなコマンドを実行する.

$ irb
> require "numru/gphys" (もしくは, "numru/ggraph")

としたとき,

=> true

となれば, 正常にインストールされていることが確認できる.

試しにデータを描いてみると,

sample