スーパーコンピュータ関連
本ページは名古屋大学情報基盤センターの大型計算機に関する内容を記述してあります. おもに, スパコンで使用するコマンド名やその使い方について説明します. 名古屋大学の大型計算機の詳細に関しては, こちら を参照してください.
qsub システム
コマンド一覧
- charge
- 現在の利用料金表示.
- lgtmp
- 名古屋大のシステムはユーザディレクトリに quota の設定がなされているため, 容量の大きなファイルは設置できない. そこで, "/" 以下に "large_tmp", "large" というquota が設定されていない共有領域が別に存在している. 本コマンドはこのうち, "large_tmp" 以下に自身の作業領域を作成するコマンドである.
- "large_tmp" と "large" の違いは, 定期的にバックアップされるかされないかの違い(_tmp はバックアップされない)
- 名古屋大のシステムはユーザディレクトリに quota の設定がなされているため, 容量の大きなファイルは設置できない. そこで, "/" 以下に "large_tmp", "large" というquota が設定されていない共有領域が別に存在している. 本コマンドはこのうち, "large_tmp" 以下に自身の作業領域を作成するコマンドである.
- qstat
- 現在のジョブ一覧表示コマンド.
- jstat
- qstat の表示フォーマットが異なるコマンド.
- 基本的に qstat と同じ.
- ただし, man パスが通っていないので, オプションなどの詳細はよくわからない.
- qsub
- qdel
- ジョブ削除コマンド.
- オプション
- -K [ジョブ番号] : 指定した番号のジョブを削除する.
並列化に関する覚書
OpenMP
環境変数
- OMP_NUM_THREADS : default = 実行マシンのコア数
- コア並列数を陽に指定.
- OMP_STACKSIZE : default = 2000(4000)
- 各スレッドがプライベートに使用するスタックサイズ (KB 指定) を陽に指定.